零申报代理记账与正常申报代理记账在多个方面存在差异。在账务处理上，正常申报代理记账需要对企业的收入、成本、费用等进行全面核算，工作量较大；而零申报代理记账主要处理少量的费用支出等账务，相对简单。例如，一家有实际业务的贸易公司，正常申报代理记账需要核算每一笔采购和销售业务，而零申报代理记账的企业可能只有一些办公费用的账务处理。

税务申报方面，正常申报代理记账要根据企业的实际经营数据计算应纳税额，申报过程较为复杂；零申报代理记账则直接进行零申报，无需计算税款。但需要注意的是，零申报并不意味着企业可以忽视税务政策，同样要关注政策变化，确保申报合规。

费用方面，如前文所述，零申报代理记账费用相对较低，正常申报代理记账由于工作量大、业务复杂，费用会更高。企业要根据自身的经营状况和财务需求，选择合适的代理记账方式。